African Journal of
Microbiology Research

  • Abbreviation: Afr. J. Microbiol. Res.
  • Language: English
  • ISSN: 1996-0808
  • DOI: 10.5897/AJMR
  • Start Year: 2007
  • Published Articles: 5112

Full Length Research Paper

Phenotypic detection of extended spectrum beta-lactamase in multidrug-resistant Escherichia coli from clinical isolates in Niamey, Niger

Alio Mahamadou Fody*
  • Alio Mahamadou Fody*
  • Laboratoire de Biologie Moléculaire d’Epidémiologie et de Surveillance des Agents Transmissibles Par Les Aliments (LaBESTA). Centre de Recherche en Sciences Biologiques, Alimentaires et Nutritionnelles (CRSBAN). Département de Biochimie-Microbiologie. UFR en Sciences de la vie et de la Terre. Ecole Doctorale Sciences et Technologies. Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso.
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Laouali Boubou
  • Laouali Boubou
  • Laboratoire de Biologie, Hôpital National de Niamey (HNN), BP 238 Niamey, Niger.
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Ali Moussa
  • Ali Moussa
  • Laboratoire de Biologie, Hôpital National Lamordé (HNL), BP 10146 Niamey, Niger.
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Hadiza Ibrahim Bawa
  • Hadiza Ibrahim Bawa
  • Laboratoire de Biologie Moléculaire d’Epidémiologie et de Surveillance des Agents Transmissibles Par Les Aliments (LaBESTA). Centre de Recherche en Sciences Biologiques, Alimentaires et Nutritionnelles (CRSBAN). Département de Biochimie-Microbiologie. UFR en Sciences de la vie et de la Terre. Ecole Doctorale Sciences et Technologies. Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso.
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Ali Konate
  • Ali Konate
  • Laboratoire de Biologie Moléculaire d’Epidémiologie et de Surveillance des Agents Transmissibles Par Les Aliments (LaBESTA). Centre de Recherche en Sciences Biologiques, Alimentaires et Nutritionnelles (CRSBAN). Département de Biochimie-Microbiologie. UFR en Sciences de la vie et de la Terre. Ecole Doctorale Sciences et Technologies. Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso.
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Chaibou Yaou
  • Chaibou Yaou
  • Laboratoire de Biologie Moléculaire d’Epidémiologie et de Surveillance des Agents Transmissibles Par Les Aliments (LaBESTA). Centre de Recherche en Sciences Biologiques, Alimentaires et Nutritionnelles (CRSBAN). Département de Biochimie-Microbiologie. UFR en Sciences de la vie et de la Terre. Ecole Doctorale Sciences et Technologies. Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso.
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Cheikna Zongo
  • Cheikna Zongo
  • Laboratoire de Biologie Moléculaire d’Epidémiologie et de Surveillance des Agents Transmissibles Par Les Aliments (LaBESTA). Centre de Recherche en Sciences Biologiques, Alimentaires et Nutritionnelles (CRSBAN). Département de Biochimie-Microbiologie. UFR en Sciences de la vie et de la Terre. Ecole Doctorale Sciences et Technologies. Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso.
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Chaibou Salaou
  • Chaibou Salaou
  • Laboratoire de Biologie, Hôpital National de Niamey (HNN), BP 238 Niamey, Niger.
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Alhousseini Daouda
  • Alhousseini Daouda
  • Laboratoire de Biochimie Hôpital National de Niamey (HNN) BP 238, Niamey, Niger.
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Ramatou Sidikou
  • Ramatou Sidikou
  • Laboratoire de Biotechnologies, Faculté des Sciences et Technologies Université Abdou Moumouni de Niamey B.P.: 12022, Niamey, Niger.
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Alfred S. Traore
  • Alfred S. Traore
  • Laboratoire de Biologie Moléculaire d’Epidémiologie et de Surveillance des Agents Transmissibles Par Les Aliments (LaBESTA). Centre de Recherche en Sciences Biologiques, Alimentaires et Nutritionnelles (CRSBAN). Département de Biochimie-Microbiologie. UFR en Sciences de la vie et de la Terre. Ecole Doctorale Sciences et Technologies. Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso.
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Nicolas Barro
  • Nicolas Barro
  • Laboratoire de Biologie Moléculaire d’Epidémiologie et de Surveillance des Agents Transmissibles Par Les Aliments (LaBESTA). Centre de Recherche en Sciences Biologiques, Alimentaires et Nutritionnelles (CRSBAN). Département de Biochimie-Microbiologie. UFR en Sciences de la vie et de la Terre. Ecole Doctorale Sciences et Technologies. Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso.
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  •  Received: 22 March 2017
  •  Accepted: 21 April 2017
  •  Published: 14 May 2017

Abstract

Extended spectrum beta lactamase (ESBL) producing Enterobacteriaceae is one of the main causes of antibiotic treatment failure in hospitals. The aim of this study was to evaluate the prevalence of ESBL produced by multidrug-resistant (MDR) Escherichia coli isolated from various clinical samples (urine, stool, pus, blood culture) in the “Hôpital National de Niamey” and the “Hôpital National Lamordé” of Niamey, Niger. Samples were processed using standard bacteriological methods. Isolates were identified by biochemical tests and confirmed on API 20 E system (Bio-Mérieux, France). Antibiotic susceptibility was determined using the disk diffusion method on Mueller-Hinton (MH) agar plates (Liofilchem, Italy). Producing of extended spectrum beta-lactamase was performed using simple double-disk synergy test (DDST) and double-disk synergy test using cloxacillin. A total of two hundred and seventeen (217) multidrug-resistant E. coli were isolated from various clinical samples. Among these isolates, 57 (26.3%) were extended spectrum beta-lactamase producers. From clinical sources, prevalence of ESBL producing E. coli was observed in urine samples (26.7%), stool samples (26.3%), pus samples (25%) and blood samples (25%). ESBL producing E. coli were observed in the age groups under 5 years (24.9%), 26 to 45 (38.1%) and over 65 years (50%). This study showed a notable prevalence of extended spectrum beta-lactamase E. coli isolated from various clinical samples in two hospitals of Niamey, suggesting the rational and judicious use of antibiotics by clinicians.

Key words: Extended spectrum beta lactamase (ESBL), multidrug-resistance, Escherichia coli, prevalence, Niamey, Niger.