African Journal of
Microbiology Research

  • Abbreviation: Afr. J. Microbiol. Res.
  • Language: English
  • ISSN: 1996-0808
  • DOI: 10.5897/AJMR
  • Start Year: 2007
  • Published Articles: 5146

Full Length Research Paper

Serotyping and antimicrobial resistance of enteropathogenic Escherichia coli and enterohemorrhagic E. coli O157 isolated from children under five years of age with diarrhea in rural Burkina Faso

Rene Dembele*
  • Rene Dembele*
  • 1. Laboratoire de Biologie Moleculaire, d epidemiologie et de surveillance des bacteries et virus transmissibles par les aliments/ Centre de Recherche en Sciences Biologique, Alimentaire et Nutritionnelle (CRSBAN)/Ecole Doctorale Sciences et Technologies (EDST)/Universite de Ouagadougou, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso; 2. Unite de Formation et de Recherche en Sciences Appliquees et Technologiques (UFR/SAT)/ Institut des Sciences de l Environnement et du Developpement Rural (ISEDR), Centre Universitaire Polytechnique de Dedougou, BP 07 Dedougou Burkina Faso.
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Isidore Juste O. Bonkoungou
  • Isidore Juste O. Bonkoungou
  • 1. Laboratoire de Biologie Moleculaire, d epidemiologie et de surveillance des bacteries et virus transmissibles par les aliments/ Centre de Recherche en Sciences Biologique, Alimentaire et Nutritionnelle (CRSBAN)/Ecole Doctorale Sciences et Technologies (EDST)/Universite de Ouagadougou, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso; 3. Laboratoire National de Sante Publique, 09 BP 24 Ouagadougou, Burkina Faso.
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Ali Konate
  • Ali Konate
  • Laboratoire de Biologie Moleculaire, d epidemiologie et de surveillance des bacteries et virus transmissibles par les aliments/ Centre de Recherche en Sciences Biologique, Alimentaire et Nutritionnelle (CRSBAN)/Ecole Doctorale Sciences et Technologies (EDST)/Universite de Ouagadougou, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso
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Gertrude Bsadjo Tchamba
  • Gertrude Bsadjo Tchamba
  • Laboratoire de Biologie Moleculaire, d epidemiologie et de surveillance des bacteries et virus transmissibles par les aliments/ Centre de Recherche en Sciences Biologique, Alimentaire et Nutritionnelle (CRSBAN)/Ecole Doctorale Sciences et Technologies (EDST)/Universite de Ouagadougou, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso
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Hadiza Ibrahim Bawa
  • Hadiza Ibrahim Bawa
  • Laboratoire de Biologie Moleculaire, d epidemiologie et de surveillance des bacteries et virus transmissibles par les aliments/ Centre de Recherche en Sciences Biologique, Alimentaire et Nutritionnelle (CRSBAN)/Ecole Doctorale Sciences et Technologies (EDST)/Universite de Ouagadougou, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso
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Evariste Bako
  • Evariste Bako
  • Laboratoire de Biologie Moleculaire, d epidemiologie et de surveillance des bacteries et virus transmissibles par les aliments/ Centre de Recherche en Sciences Biologique, Alimentaire et Nutritionnelle (CRSBAN)/Ecole Doctorale Sciences et Technologies (EDST)/Universite de Ouagadougou, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso
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T. Serge Bagre
  • T. Serge Bagre
  • Laboratoire de Biologie Moleculaire, d epidemiologie et de surveillance des bacteries et virus transmissibles par les aliments/ Centre de Recherche en Sciences Biologique, Alimentaire et Nutritionnelle (CRSBAN)/Ecole Doctorale Sciences et Technologies (EDST)/Universite de Ouagadougou, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso
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Asseta Kagambega
  • Asseta Kagambega
  • 1. Laboratoire de Biologie Moleculaire, d epidemiologie et de surveillance des bacteries et virus transmissibles par les aliments/ Centre de Recherche en Sciences Biologique, Alimentaire et Nutritionnelle (CRSBAN)/Ecole Doctorale Sciences et Technologies (EDST)/Universite de Ouagadougou, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso; 4. Institut Des Sciences (IDS), 01 BP 1757 Ouagadougou 01, Burkina Faso.
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Cheikna Zongo
  • Cheikna Zongo
  • Laboratoire de Biologie Moleculaire, d epidemiologie et de surveillance des bacteries et virus transmissibles par les aliments/ Centre de Recherche en Sciences Biologique, Alimentaire et Nutritionnelle (CRSBAN)/Ecole Doctorale Sciences et Technologies (EDST)/Universite de Ouagadougou, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso
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Alfred S. Traore
  • Alfred S. Traore
  • Laboratoire de Biologie Moleculaire, d epidemiologie et de surveillance des bacteries et virus transmissibles par les aliments/ Centre de Recherche en Sciences Biologique, Alimentaire et Nutritionnelle (CRSBAN)/Ecole Doctorale Sciences et Technologies (EDST)/Universite de Ouagadougou, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso
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Nicolas Barro
  • Nicolas Barro
  • Laboratoire de Biologie Moleculaire, d epidemiologie et de surveillance des bacteries et virus transmissibles par les aliments/ Centre de Recherche en Sciences Biologique, Alimentaire et Nutritionnelle (CRSBAN)/Ecole Doctorale Sciences et Technologies (EDST)/Universite de Ouagadougou, 03 BP 7021 Ouagadougou 03, Burkina Faso
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  •  Received: 24 February 2015
  •  Accepted: 25 March 2015
  •  Published: 08 April 2015

Abstract

Diarrheagenic Escherichia coli (DEC) is one of the main causes of acute gastroenteritis in infants and young children in sub-Saharan Africa. This study investigated the prevalence, serotypes and antibiotic resistance patterns of enteropathogenic E. coli (EPEC) and enterohemorrhagic E. coli (EHEC) among diarrheal children in rural Burkina Faso. Stool specimens were collected from 280 children under 5 years of age visiting hospital due to acute diarrhea between July 2009 and June 2010. E. coli isolates were subjected to serotyping and their susceptibility to 9 antimicrobial agents was determined by the disc diffusion method. Sixty patients (21.4%) had DEC of which 54 strains (19.3%) belonged to EPEC O serogroups and six (2.1%) to EHEC O157 serotype. A higher rate of EPEC (91.6%) was found in patients aged less than 2 years. More than 70% of E. coli isolates were resistant to ampicillin, amoxicillin/clavulanic acid, tetracycline, trimethoprim-sulfamethoxazole and 28.3% to nalidixic acid. Twenty three (38.3%) of the isolated E. coli were ESBL producers with higher prevalence (56.5%) in children under 12 months of age. This study stresses the public health importance of diarrheal E. coli with serotypes of EPEC and EHEC O157 and their resistance to antibiotics in Burkina Faso.

Key words: Escherichia coli serotypes, antibiotics resistance, diarrheal children, Burkina Faso.